Communautés bactériennes marines et pollution microbienne

Code UE : GEM105

  • Cours + travaux pratiques
  • 5 crédits
  • Volume horaire de référence
    (+ ou - 10%) : 45 heures

Responsable(s)

Isabelle POIRIER

Ecole des transitions écologiques Depuis sa création en 1794, le Cnam accompagne les évolutions du monde professionnel et industriel. Par ses missions de formation, de recherche et de diffusion de la culture scientifique et technique, il est un acteur majeur de toutes les transitions : écologique, énergétique, numérique, économique, pédagogique, sociétale...

Pour répondre au mieux à ses missions, l'établissement ouvre l'École des transitions écologiques.

Public, conditions d’accès et prérequis

Accessible aux étudiants ayant validé 120 ECTS dans une formation scientifique supérieure et ayant de bonnes connaissances en microbiologie et biologie moléculaire.

Objectifs pédagogiques

Présentation des communautés bactériennes des différents compartiments du milieu marin.
Présentation du rôle de ces communautés bactériennes.
Présentation de la potentialité de certaines bactéries marines dans les mécanismes de bio-remédiation.
Présentation des différentes étapes de la mise en place d’un biofilm bactérien.
Présentation du phénomène de biocorrosion.
Présentation des techniques moléculaires utilisées en écologie microbienne.
Présentation de l’utilisation de la spectrométrie de masse pour identifier rapidement des souches bactériennes marines.
 

Contenu

- Communautés bactériennes marines.
- Processus de bio-remédiation.
- Biofilms et Biocorrosion.
- Pollution microbienne.
- Outils moléculaires appliqués à l'écologie microbienne.
- Identification bactérienne par spectrométrie de masse.

Modalité d'évaluation

Examens théoriques ; TP/TD notés

Bibliographie

  • Stéphan Jacquet, Anne-Claire Baudoux, Yves Desdevises, Soizick F. Le Guyader : LES VIRUS MARINS Simples parasites ou acteurs majeurs des écosystèmes aquatiques ?
  • Olivier Pereira : La métagénomique pour étudier diversité et fonction des communautés microbiennes marines : un focus sur les Archaea du Marine Groupe II (MGII) - Thèse de doctorat
  • Jean-Claude BERTRAND, Pierre CAUMETTE, Philippe LEBARON, Robert MATHERON, Philippe NORMAND : Ecologie microbienne Microbiologie des milieux naturels anthropisés

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Contact

Cnam-Intechmer
Boulevard de collignon
50110 Cherbourg en cotentin
Tel :02 33 88 73 40
Service scolarité

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