Bases de microbiologie générale

Code UE : AGR100

  • Cours
  • 3 crédits

Responsable national

Marion POMMET

Responsable opérationnel

Public et conditions d'accès

Bac + 2 dans les domaines des sciences du vivant ou de la chimie.

Objectifs pédagogiques

Faire acquérir les connaissances de base indispensables dans le domaine de la microbiologie. Tout en abordant les notions fondamentales de morphologie et de structure des microorganismes, cet enseignement mettra l'accent tout particulièrement sur l'écologie microbienne, l’influence de l’environnement physico-chimique sur la croissance microbienne, ainsi que sur les méthodes et les techniques d'études des micro-organismes.

Compétences visées

Comprendre l’influence de l’environnement physico-chimique sur la croissance microbienne.
Identifier les méthodes d’analyse microbiologique.

Mots-clés

Contenu

Microbiologie générale
   Morphologie et structure des microorganismes
   Métabolismes microbiens
   Taxonomie microbienne
 
Croissance microbienne
   Cinétique de croissance microbienne
   Influence des paramètres physico-chimiques (température, pH, activité de l'eau, potentiel d’oxydo-réduction)
   Ecologie microbienne (influence de la nature du substrat, synergies et compétitions)
 
Méthodologie de l'analyse microbiologique
   Observation au microscope (état frais, Gram, Malassez)
   Culture sur gélose et en liquide (NPP)
   PCR et qPCR
   Hybridation in situ
   Elisa et iPCR

Modalité d'évaluation

Devoir maison à mi-semestre; examen écrit d'une heure permettant d'évaluer les compétences acquises.

Bibliographie

  • Paolozzi L, Liébart JC, Bauda P : Biologie des procaryotes et de leurs virus. Dunod. 2015
  • Prieur D, Geslin C, Payan C : Mini Manuel de Microbiologie. 2ème édition. Dunod. 2015
  • Prescott, Harley, Klein, Wiley, Sherwood, Woolverton : Microbiologie. 3ème édition. De Boeck. 2010
  • Tortora GJ, Funke BR, Case CL : Introduction à la microbiologie. 2ème édition. Pearson. 2012

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